石斑鱼40K基因组育种液相芯片—石斑1号

日前，由中山大学生命科学学院张勇教授科研团队联合华南农业大学、深圳市华大海洋研究院、广东省农业科学院和博瑞迪生物技术有限公司共同完成了“石斑1号”石斑鱼40K基因组育种液相芯片的研发，现在海南晨海水产有限公司、广东海威农业集团有限公司、广东海元农业科技有限公司、阳江市渔乡子水产科技实业有限公司开展应用，为石斑鱼养殖产业健康和可持续发展，培育更加优质、高产、抗病和抗逆的石斑鱼良种提供种业支撑。
“石斑1号”芯片采用博瑞迪GBTS技术体系中的GenoBaits^®技术，含有5种主养石斑鱼（鞍带石斑鱼、棕点石斑鱼、斜带石斑鱼、赤点石斑鱼、清水石斑鱼）的全基因组重测序SNP标记和重要经济性状关联SNP、InDel标记。“石斑1号”芯片的标记可均匀覆盖全基因组、涵盖多种石斑鱼多态性标记，在石斑鱼群体中有较好的应用表现。该芯片含有来源于数百份重测序数据变异信息的45,608个背景多态性SNP标记和基于千份重测序样本数据得到的氨氮耐受性、赤点石斑神经坏死病毒（RGNNV）抗性、生长、饲料利用率等重要经济性相关的108个功能关联SNP、InDel标记。利用该芯片可以对5种石斑鱼育种个体的基因遗传信息进行快速精准的检测和分析。经样本测试，“石斑1号”芯片对5种石斑鱼检测后的标记平均检出率为91.09%，其中鞍带石斑鱼检出率为99.6%～99.7%，棕点石斑鱼检出率为90.82%～91.03%，均表现出较好的基因型分型检测效果。